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Aloantígenos alélicos frequentemente responsáveis pelas rejeições fracas aos enxertos nos casos em que a histocompatibilidade (maior) foi estabelecida por testes padronizados. No camundongo estes antígenos são codificados por mais de 500 genes em até 30 loci de histocompatibilidade menor. Nos mamíferos, o antígeno de histocompatibilidade menor mais conhecido é o antígeno H-Y.
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