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ARN preparado usualmente por transcripción a partir de ADN clonado, el cual es complementario de un ARNm específico o ADN y que se usa generalmente para estudiar genes de virus, distribución de ARN específico en tejidos y células, integración de ADN viral a los genomas, transcripción, etc. En tanto es preferible usar las SONDAS ADN a nivel macroscópico para detectar la presencia de ADN/ARN de especies o subespecies específicas, las sondas ARN se prefieren para estudios genéticos. El marcaje convencional para las sondas ARN incluyen los radioisótopos 32P y 125I y el marcador químico biotina. Las sondas ARN pueden dividirse por categorías en sondas ARN de sentido +, sondas ARN de sentido -, o sondas ARN antisentido.
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